매매기회를 포착하여 주문을 내는 과정이 자동적으로 이루어질 수 있게 만든 거래방식이다. 미리 정한 조건을 충족하는 시장상황이 연출되면 지체 없이 주문이 자동으로 나가게 된다. 거래 건수가 많아지므로 시장가격에 미칠 영향(시장충격, market impact)을 최소화하기 위해 주문을 소규모로 분할하고 단시간에 많은 주문을 내도록 해야 한다. 시장 환경에 대응하여 매매전략이 수시로 변하므로 주문 취소율도 증가하며, 따라서 거래체결률은 낮아진다.
알고리즘 거래는 시장에 풍부한 유동성을 제공하는 긍정적인 효과도 있지만 시장 안정성을 해친다는 시각도 적지 않다.
